Peler, laver les oignons et les couper en rondelles.
Les déposer dans une cocotte avec 3 cs d'eau,3 cs d'huile d'olive et une pincée de sel. Couvrir et laisser cuire entre 30 et 40 minutes. Ils doivent être confits et peu colorés. Retirer le couvercle en fin de cuisson afin de laisser évaporer le jus. Laisser refroidir.
Faire de même avec les poireaux. Laisser refroidir.
Préchauffer le four à 200°C.
Etaler la pâte. Ajouter les oignons et les poireaux refroidis.
Saupoudrer de thym, répartir les filets d'anchois et les olives noires. Arroser d'huile d'olive et enfourner pour environ 20 minutes.